בחירת סוג הצנתר צריכה להתבסס על התאמה מיטבית למטופל בהתבסס על שיקולים פיזיים כמו מגדר, מבנה גוף ואנטומיה של השופכה ואברי המין,יכולות מוטוריות ידיים, שיקולים קוגניטיביים ושגרת היום¹ .

קיימים סוגי צנתרים שונים לשימוש בצנתור עצמי ההנבדלים זה מזה במספר פרמטרים:

• שימוש חד פעמי או רב פעמי- הנטייה הרווחת בספרות הינה להמליץ על צנתרים לשימוש חד פעמי, עם ציפוי הידרופילי ¹
• קוטר ואורך – לנוכח השונות בין המטופלים וצורכיהם אין צנתר אחד המתאים לכולם.¹

יש  להתאים את קוטר הצנתר למטופל באופן שיאפשר פינוי שתן בזמן המהיר ביותר ללא גרימת נזק לשופכה ואי נוחות למטופל.

אורך הצנתר מאפשר התאמה לשונות המגדרית ולהתאמה מיטבית¹ . מומלץ לבחור בחברה שיש לה מגוון רחב שמאפשר התאמה מיטבית גם אם הגוף או הצרכים משתנים כמו במקרה של ילדים שגדלים.

• ציפוי בחומר סיכוך הידרופילי– שימוש בצנתר מצופה בחומר סיכוך מקל על השימוש ומצמצם סיבוכים הקשורים בצנתור עצמי לאורך זמן. על כן, במקרים בהם נעשה שימוש בצנתר לא מצופה, מומלץ לעשות שימוש בחומר סיכוך מקדים¹.

ישנם צנתרים ארוזים בצורה מסוככת המוכנים לשימוש, בעוד אחרים מצריכים הוספת מים לצנתר על מנת להפעיל (לאקטב) את תהליך הסיכוך.

כאשר הצנתר מגיע מסוכך ומוכן לשימוש השימוש נוח יותר למשתמש:  האריזה לא מכילה נוזל, אין סכנת טפטוף וגם בעלי בעיה מוטרית בידיים יכולים לעשות בו שימוש כי חובה לפוזיציה אנכית של האריזה.

• צנתר (CATH) או סט (SET)- צנתר בלבד לניקוז שתן שמתנקז לאסלה או סט מבוסס על one-in-All וכולל בנוסף לצנתר עם סיכוך מקדים גם שקית לאיסוף שתן¹. במקרים של שהות בחוץ ללא שירותים יש יתרון במוצר כזה.

• סוג החומר ממנו עשוי הצנתר- הצנתרים החד פעמיים הקיימים היום מיוצרים בעיקר מ־PVC ,סיליקון או Acetate Vinyl Ethylene. סוג החומר משפיע על גמישות¹ הצנתר ונוחות השימוש בו.
• קצה הצנתר- קיימים צנתרים בעלי קצוות שונים:
• נלטון (Nelaton) קצה הצנתר השכיח ביותר בשימוש. בעל קצה ישר, גמיש ועגול. יכול להתאים לנשים וגברים.
• טימן (Coude/ Tiemann)- קצה צנתר מעוקל במקצת ומעוגל למניעת פציעות, מותאם למבנה אנטומי של גבר.
• צנתר יעודי המותאם למבנה האנטומי של האישה